Projet: suivi de la circulation des souches de Coronavirus félin en élevage


Projet présenté par Sophie Le Poder Pr en virologie ENVA, lors de l'assemblée générale du LOOF du 15 juin 2019. Financement par AGRIA sur deux ans (budget 10.953 €  HT).

 

Objectif: étudier comment apparaissent les cas de PIF en élevage.

 

Les virus FeCV (coronavirus bénins) et FIPV (coronavirus pathogènes responsables de la PIF) sont très semblables, ils diffèrent probablement sur 2 gènes, (gène S et gène ORF3c).

 

Méthode/Protocole

 

  1.  Un questionnaire sera envoyé aux éleveurs pour mieux connaitre l’incidence de la PIF en élevage.
  2.  Recrutement de 2 élevages volontaires (si possible un élevage sans cas de PIF et un élevage avec des cas de PIF).
  3. Suivi mensuel sur 2 ans de la circulation des souches FCoV par écouvillon rectal (en particulier sur chatte reproductrice et chatons), 
  4.  Suivi de l’excrétion virale fécale chez les animaux au cours du temps, 
  5. Caractérisation génétiques des souches virales circulantes (en collaboration avec le Dr M. Le Gouil, université de Caen)

 

Planning des recherches : 

 

La 1ère année : 

  •  Envoi du questionnaire aux éleveurs
  •  Sélection d’au moins deux élevages volontaires
  •  Envoi mensuel de selles des animaux de l’élevage vers l’UMR 1161 Virologie/ENVA
  •  Evaluation par RT-qPCR de la présence du coronavirus félin chez les différents animaux
  •  Présentation au conseil scientifique du LOOF des données en cours obtenus/rapport d’étape

 

La 2ème année :

  • Séquençage par la technologie SANGER des gènes S et ORF3c
  • Séquençage haut-débit et analyses des quasi-espèces virales au cours du temps sur une sélection de prélèvements d’animaux, en priorité ceux ayant déclaré une PIF
  • Présentation au conseil scientifique du LOOF des données obtenus, publication scientifique

 

Les résultats attendus :

  • Incidence de la PIF en élevage félin (via les résultats du questionnaire)
  • Une première caractérisation moléculaire fine en prospective des souches FCoV, en amont des cas de PIF
  • Une étude pilote pour déterminer quel est le scénario le plus probable expliquant la survenue de cas de PIF en élevage
  • Conseils de prophylaxie sanitaire pour minimiser les risques d’apparition de cas de PIF 

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